Im Rahmen des Professorinnenprogramms des Bundes und der Länder wurde 2008 erstmalig ein Gleichstellungskonzept für die Universität Paderborn aufgestellt. Aufgrund des großen Erfolgs wurde das Programm im Jahr 2012 (Professorinnenprogramm II) fortgeführt. 2018 nahm die Universität Paderborn mit ihrem Gleichstellungszukunftskonzept an dem Professorinnenprogramm III teil und wurde erneut positiv begutachtet.

Die Universität hat 2025 beim Professorinnenprogramm 2030 erneut mit ihrem Gleichstellungskonzept überzeugt und wurde zudem als eine von insgesamt 12 Hochschulen mit dem Prädikat „Gleichstellungsstarke Hochschule“ ausgezeichnet.