Die Fakultäten der Universität Paderborn können für herausragende wissenschaftliche Leistungen den Doktorgrad "honoris causa" verleihen. Weitere Kriterien sind die Persönlichkeit des/r zu Ehrenden und sein/ihr Bezug zur Hochschule. Der/die zu Ehrende darf nicht hauptamtlich an der Universität tätig sein.
| Jahr der Verleihung | |
| 1993 | Dipl.-Ing. Heinz Hemfort (Vorstandsmitglied der Westfalia Separator AG in Oelde), verliehen durch den damaligen Fachbereich 10, Maschinentechnik |
| 1998 | Prof. Dr. Albrecht Pietsch (Friedrich-Schiller-Universität Jena), verliehen durch den damaligen Fachbereich 17, Fach: Mathematik |
| 2000 | Prof. Dr. Günter Hotz (Universität des Saarlandes Saarbrücken), verliehen durch den damaligen Fachbereich 17, Fach: Informatik |
| 2005 | Andreas Mertin (Evangelischer Theologe und Religionspädagoge), verliehen von der Fakultät für Kulturwissenschaften, Institut für Evangelische Theologie |
| 2009 | Dr. Reinhard Höppner (Mathematiker und Ministerpräsident a. D.), verliehen von der Fakultät für Kulturwissenschaften, Institut für Evangelische Theologie |
| 2009 | Prof. Dr. Bernd Schauenberg (Albert-Ludwigs-Universität Freiburg), verliehen von der Fakultät für Wirtschaftswissenschaften |
| 2010 | Prof. Dr.-Ing. Manfred Nagl (RWTH Aachen), verliehen von der Fakultät für Elektrotechnik, Informatik und Mathematik, Institut für Informatik |
| 2011 | Prof. Dr. sc. techn. Dr. h.c. mult. Alfred Fettweis (Ruhr-Universität Bochum), verliehen von der Fakultät für Elektrotechnik, Informatik und Mathematik |
| 2012 | Herta Müller (Literatur-Nobelpreisträgerin), verliehen von der Fakultät für Kulturwissenschaften |
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